电影《灵魂互换后沈总每天都撩我》的剧情设定在2024年的现代都市。故事的主角是两个身份迥异的人——一个是平凡无奇的白领小职员，另一个则是冷酷无情却事业有成的沈氏集团总裁沈总。一次偶然的机会，他们在一场神秘的雷暴中发生了灵魂互换。

小职员突然发现自己身处沈总的豪宅，而沈总则意外地过上了朝九晚五、挤地铁的生活。两人开始努力适应彼此的生活节奏和身份角色，但很快就发现这并非易事。沈总在公司里的冷酷作风引来了同事们的误解和反感，而小职员则因为对商业一无所知而闹出了不少笑话。

随着时间的推移，两人在不断的摩擦和碰撞中逐渐理解了彼此的不易，也慢慢产生了情感。他们开始尝试帮助对方解决生活中的问题，同时也在这个过程中发现了自己的不足和成长。最终，在一场惊心动魄的危机之后，两人的灵魂得以互换回来，但他们的心却已经紧紧相连。